Уважаемая Елена. Основным  источником неприятного запаха являются инфекционные заболевания носовых пазух и дыхательных путей, воспаление миндалин, заболевания желудочно-кишечного тракта,  печени и желчного пузыря, почечная недостаточность, а также рак, туберкулез, сифилис и огромное количество заболеваний слизистой оболочки полости рта. Для профилактики и лечения неприятного запаха во рту необходимо выполнение следующих мер:

По возможности отказаться от курения;
Чистка зубов должна проводиться с помощью зубной щетки и флосса. Очистка языка — важнейшая часть гигиенического ухода за полостью рта.
Необходимо использовать дополнительные средства гигиены полости рта — ополаскиватели, зубочистки;
Придерживаться рационального питания, для профилактики кариеса ограничить частоту употребления сладостей; употреблять в пищу достаточное количество клетчатки, зелени, овощей и фруктовых соков;
Применять освежители дыхания;
Пройти лечение воспалительных заболеваний тканей пародонта;
Пройти полное обследование с выявлением всех потенциальных очагов хронической инфекции.

Вы, Елена, вполне профессионально судите о перечне возможных бактериологических исследований, вполне правильно полагая, что воспалительный процесс поддерживают  бактерии, результатом жизнедеятельности которых являются сернистые соединения, служащие основной причиной неприятного запаха. Небольшое уточнение: поиск причины и борьбу необходимо вести вместе с гастроэнтерологом – в этой ситуации Вам успех обеспечен.